مطالعه عددی برهمکنش میان مولکول های زیستی و نانوساختارها 

استاد راهنما: دکتر ناصر شاه طهماسبی؛ دکتر محمود رضایی رکن آبادی

استا مشاور: دکتر فاطمه موسوی بایگی؛ دکتر راحله پیله ور

دانشجو: پری سادات مداحی؛ سارا آل شیخ

 

mesara

 

 

 در این پژوهش که در قالب دو پایان نامه دکتری انجام گرفت، از رهیافت تابعی چگالی و توابع گرین غیر تعادلی برای بررسی برهمکنش میان نانو ساختارها و مولکول های زیستی استفاده شد. در این راستا، نانو لوله های اکسید روی و نانو نوارهای سیلیکن به عنوان نانو ساختار و آمینو اسیدهای آروماتیک و نوکلئوباز ها به عنوان مولکول های زیستی مدل سازی شدند. هدف نهایی بررسی میزان حساسیت این نانو ساختارها به مولکول های زیستی ذکر شده بود که به این منظور از رهیافت تابع گرین غیر تعادلی برای بررسی میزان ترابرد الکترونی سیستم ها استفاده شد.

در گام بعدی، حساسیت نانوساختارهای اکسید روی نسبت به تغییرات پسارونویسی (post translational modifications) مورد بررسی قرار گرفت که نتایج حاکی از حساسیت خوب این نانو لوله ها نسبت به این تغییرات بود. نتایج این پژوهش ها در مجلات معتبر به چاپ رسیده است:

  •  Site specific interaction of aromatic amino acids with ZnO nanotubes: A density functional approach, Computational and Theoretical Chemistry 1086 (2016) 36–44
  •  Exploring the sensitivity of ZnO nanotubes to tyrosine nitration: A DFT approach, Physics Letters A, 380 (2016) 2090–2097
  • Interaction of nucleobases with silicene nanoribbon: A density functional approach, Computational and Theoretical Chemistry 1103 (2017) 32–37